$ R
/share/bioinfo/anaconda3/bin/R: line 238: /share/bioinfo/anaconda3/lib/R/etc/ldpaths: No such file or directory

这个问题出现在 centOS 系统,用 conda 安装 R。

 

解决办法:

1. 重装 R

搜索可用的版本

$ conda search r-base
Loading channels: done
# Name                       Version           Build  Channel             
。。。
r-base                         3.5.1      h1e0a451_2  pkgs/r              
r-base                         3.5.1      h1e0a451_2  r                   
r-base                         3.5.1   h271c98b_1006  conda-forge         
r-base                         3.5.1      h391c2eb_4  conda-forge         
r-base                         3.5.1      h391c2eb_5  conda-forge         
r-base                         3.5.1   he45234b_1004  conda-forge         
r-base                         3.5.1   he45234b_1005  conda-forge         
(base) 

重装 R,指定版本

conda install r-base=3.5.1=he45234b_1004

2. 注释掉这一行

anaconda3/etc/conda/activate.d/activate-r-base.sh

# R CMD javareconf > /dev/null 2>&1 || true